باماکو به عنوان پایتخت اسلامی مالی خدمت می‌کند و دارای مسجد جامع باشکوه و مساجد متعدد با معماری سنتی سودان-ساحل است که قرن‌ها میراث اسلامی را منعکس می‌کند. این شهر از زمان‌های قرون وسطی مرکز مهمی برای آموزش و تجارت اسلامی بوده است، با ارتباطات تاریخی با امپراتوری‌های بزرگ اسلامی غرب آفریقا از جمله امپراتوری مالی. امروزه بیش از 90 درصد از جمعیت باماکو مسلمان هستند و سنت‌های غنی اسلامی را از طریق بازارهای پرجنب و جوش، مدارس قرآنی، و حفظ هنرها و صنایع دستی سنتی اسلامی حفظ می‌کنند.