Johor Bahru berperanan sebagai jantung kerohanian negeri Johor dengan Masjid Negeri Sultan Abu Bakar yang megah, dibina pada tahun 1900, mempamerkan seni bina Victoria-Moorish yang menakjubkan dengan empat menara tinggi yang menghadap Selat Johor. Bandar ini mempunyai akar Islam yang mendalam sejak Kesultanan Johor yang ditubuhkan pada tahun 1528, menjadikannya pusat penting budaya dan pemerintahan Melayu-Islam. Komuniti Muslim yang kuat terus berkembang maju melalui pendidikan Islam tradisional, aktiviti masjid yang cergas, dan pemeliharaan tradisi Islam diraja yang berkaitan dengan keluarga diraja Johor.