لاگوس میزبان مساجد تاریخی متعددی از جمله مسجد مرکزی جزیره لاگوس و مسجد شیتا بِی است که معماری زیبای اسلامی را با مناره‌های متمایز و سالن‌های نماز به نمایش می‌گذارد. این شهر به عنوان مرکز اصلی جامعه مسلمان نیجریه با مؤسسات آموزش اسلامی و اعمال مذهبی پر جنب و جوش عمل می‌کند. جمعیت متنوع مسلمان لاگوس از طریق جشنواره‌های اسلامی، بازارها و سازمان‌های اجتماعی سهم قابل توجهی در بافت فرهنگی شهر دارد.