زاهدان به عنوان مرکز معنوی جامعه مسلمان اهل سنت ایران، به ویژه قوم بلوچ، با مساجد متعددی که معماری سنتی اسلامی را منعکس می‌کنند، خدمت می‌کند. این شهر میزبان مؤسسات مذهبی مهمی از جمله مسجد جامع و مدارس اسلامی است که به منطقه گسترده‌تر سیستان و بلوچستان خدمت می‌کنند. زاهدان به عنوان مرکز اصلی علوم اسلامی اهل سنت و فرهنگ در ایران، سنت‌های مذهبی قوی را حفظ کرده و میزبان گردهمایی‌های اسلامی مهم در طول سال است.